U Odjelu se zaprimaju i obrađuju zahtjevi za dobivanje oznake kontroliranog zemljopisnog podrijetla vina, vezano za to provode se i očevidi na terenu. Izrađuju se prijedlozi Ministarstvu poljoprivrede za izdavanje rješenja za obivanje oznake kontroliranog zemljopisnog podrijetla. U Odjelu se pripremaju stručna mišljenja vezana za uvrštavanje sorti vinove loze na Preporučenu sortnu listu, provode se poslovi potvrđivanja sukladnosti proizvoda sa specifikacijom proizvoda za zaštićene oznake izvornosti.
Odjel vodi Evidenciju proizvođača i proizvodnje voćnih vina, vodi evidenciju prijava berbi grožđa za proizvodnju predikatnih vina, organizira i provodi nadzor takvih berbi. U Odjelu se prikupljaju podaci iz područja vinogradarstva za pripremu autentičnih vina te se vodi baza podatak o autentičnim vinima.