Odjel provodi introdukciju i istraživanje novih sorata i podloga voćnih vrsta te opisuje i vrednuje plodove. U sklopu Odjela provodi se nacionalni program očuvanja i održive uporabe biljnih genetskih izvora za hranu i poljoprivredu u Republici Hrvatskoj. U kolekciji se nalazi više od 290 primki ( sorata ) autohtonih i udomaćenih voćnih vrsta koje su se tradicionalno uzgajale na području kontinentalne Hrvatske.