Sjedište Centra je na adresi Vinkovačka cesta 63c, Osijek, gdje je ujedno smješten i Ured ravnatelja.
Zavod za zaštitu bilja ima sjedište na adresi Gorice 68b, Zagreb. Dio djelatnosti obavlja i na lokacijama Zvonimirova 14a Solin i Tisno bb, Opuzen. Zavod za vinogradarstvo i vinarstvo nalazi se na adresi Jandrićeva 42, Zagreb. Zavod za sjemenarstvo i rasadničarstvo posluje na adresi Usorska 19, Brijest-Osijek. Zavod za voćarstvo koji ima sjedište na adresi Gorice 68b, Zagreb, a dio djelatnosti obavlja i na lokacijama Zelina, Kaštela i Opuzen.